भारतीय तिलहन अनुसंधान संस्थान (IIOR) पूर्व में तिलहन अनुसंधाननिदेशालय की स्थापना 1 अगस्त 1977 को ऑल इंडिया कोऑर्डिनेटेड रिसर्च प्रोजेक्ट ऑन तिलहन (AICORPO) के उत्थान के साथ हुई थी। मूंगफली, रेपसीड-सरसों, तिल और रामतिल, अलसी, अरंड, कुसुम और सूरजमुखी के लिए सात परियोजना समन्वयकों की सहायता से इसे राजेंद्रनगर, हैदराबाद के मुख्यालय द्वारा संचालित किया गया। मूंगफली और रेपसीड-सरसों के लिए राष्ट्रीय अनुसंधान केंद्र की स्थापना के साथ इन्हें क्रमशः 1979 और 1993 में निदेशालय से हटा दिया गया। अप्रैल 2000 में, तिल, रामतिलऔर अलसी पर AICRP के द्वारा भारतीय तिलहन अनुसंधान संस्थानके प्रशासनिक नियंत्रण से अलग कर दिया गया है। तिलहन अनुसंधान निदेशालय को भारतीय तिलहन अनुसंधान संस्थान  में अपग्रेड करने के साथ, वर्तमान में जनादेश वाली फसलों जैसे अरंड, कुसुम और सूरजमुखी के साथ तिल, रामतिल और अलसी का जोड़ा गया है।